公元1598年，日本战国时代最具传奇色彩的大名丰臣秀吉猝死，德川家康成为五大老之首。1600年，在他手下最为杰出的忍者服部半藏的辅佐下，进攻上杉景胜。接著于当年9月的关原之战打败石田三成，掌握了全国政权。统一政权后，德川家康命令服部半藏及其麾下忍者在全国大肆搜捕与之对抗的大名残余势力，1603年，由于有人告密，风魔流首领小太郎被捕，后以火刑处死，风魔流灭亡。在这个家康最为担心的人死后，日本似乎暂时平静了几年，然而好景不长，1603年，在德川的首府江户城的上空出现了一片血红色的云层，城内传出了有怪物袭击人的事件。同时，如日中天的家康在此时把将军的职位交给了儿子秀忠而后不知所终，这一切究竟是怎么回事?就在这一天，一个神秘的身影出现在了江户城……