为了应付近代的威胁，因而成立了日本情报防卫部队。此举被视为违反日本战後宪法和国际法，韩国和中国大表不满。私底下，情报防卫部队头子开始启动资讯战攻击日本，并将过错推给北韩。当美国介入时，基於日本战後宪法第九条，美国同时也发动的攻击，迫使北韩将战事扩大，并先发制人地入侵南韩。随着朝鲜半岛战事的爆发，山姆．费雪（Sam Fisher）必须阻挠日本将军、神经质的电脑骇客，以及国际佣兵公司的联盟，避免太平洋再度陷入大规模的世界大战。